Вот в таком университете и оказался осенью 1491 года молодой Николай Коперник. Он записался на факультет свободных искусств, о чем свидетельствует сохранившаяся запись в Книге Матрикула (Metricae Studiosorum) Краковского университета. Нам неизвестно точно, сколько лет занимался Коперник в Краковском университете, об этом не сохранилось никаких записей. Однако различные факты свидетельствуют о том, что он учился до весны 1495 года.
Были ли у Коперника какие-либо астрономические познания до поступления в университет - неизвестно, у нас нет точных данных о том, где он обучался до этого. Однако совершенно ясно, что молодой Коперник по прибытию в Краков занялся изучением астрономии, ибо на факультете свободных искусств Краковского университета ей уделялось ведущее место. Слушал ли Коперник лекции Войцеха из Брудзева? Вряд ли, ибо с 1490 года Вой-цех из Брудзева уже не читал лекции по астрономии. Однако по традиции, согласно мнению профессора математики Краковского университета начала XVII века Яна Брожека, принято считать, что Коперник был учеником Войцеха из Брудзева. Впрочем, не столь уж и существенно, слушал ли Коперник его лекции по астрономии или мет. Ведь он слушал в те годы лекции целой плеяды учеников и воспитанников Войцеха из Брудзева, работавших в Кракове и излагавших мысли и идеи своего учителя. Не исключено также, что Коперник был знаком с Войцехом из Брудзева. Во всяком случае, почти с уверенностью можно сказать, что он слушал его лекции о трудах Аристотеля, а в своей книге О вращениях небесных сфер, как это видно из текста, во многом использовал работы Войцеха из Брудзева. Поэтому можно смело сказать, что основы астрономических познаний Коперника были заложены Войцехом из Брудзева и созданной им астрономической школой.
О годах учебы Николая Коперника у нас почти нет точных сведений, однако мы можем строить некоторые предположения на основании известных нам лекций в Кракове в 1491-1495 годы. По всей вероятности, вначале он ознакомился с предметами, входившими в программу низшего курса математических наук, такими как арифметика и перспектива, а также посещал, надо думать, лекции по философии Яна из Глогова и Войцеха из Брудзева. Для тогдашних студентов лекции были основным источником знаний, поскольку печатные книги были редкостью, к тому же стоили немалых денег. Однако уже во время учебы в Кракове у Коперника было несколько собственных книг по математике и астрономии, а именно: Элементы Эвклида (изд. в 1482 г.), Tabulae Directionum (Таблицы направлений) Региомонтана (изд. в 1490 г.) и Tabulae Alphonsi Regis (Таблицы короля Альфонса, изд. в Венеции в 1492 г.).
Из университетских лекций Яна из Глогова и учеников Войцеха из Брудзева, комментарий которого к Новой теории планет Пурбаха преподавался в Кракове, Коперник узнал о противоречиях, существовавших в подходе к построению мироздания, а именно о двух моделях, с одной стороны -физической модели гомоцентрических сфер, а с другой - геометрической модели эксцентриков и эпициклов. Эти противоречия могли пробудить в критическом уме молодого студента сомнения в правильности обеих моделей и потребность в замене их иной моделью построения мироздания. Впрочем, сам Коперник в предисловии к своему труду О вращениях, адресованном папе Павлу III, писал так:
"..я ничем иным не был приведен к мысли придумать иной способ вычисления движения небесных тел, как только тем обстоятельством, что относительно исследований этих движений математики не согласны между собой". Со всей очевидностью он писал далее, что имеет в виду сторонников теории гомоцентрических сфер и сторонников теории эксцентриков и эпициклов. И хотя в университетских лекциях в Кракове ни в коей мере не ставилась под сомнение правильность геоцентрической системы построения мира, все же высказывались критические замечания в адрес некоторых концепций Птолемея. В особенности же в комментарии Войцеха из Брудзева к сочинению Пурбаха критиковались основные понятия теории Птолемея, какими были экванты, которые назывались математической фикцией, противоречащей принципу равномерного вращательного движения. На лекциях же Яна из Глогова Коперник мог слышать такое, например, высказывание:
«Солнце является достойнейшей планетой, а значит его влияние самое благородное. Эта планета самая достойная, она управляет всем движением, руководит им и измеряет. Солнце достойнее остальных звезд и планет».
Конечно, Ян из Глогова был сторонником теории геоцентрического построения мира и не допускал и мысли, чтобы Земля могла осуществлять какое-либо движение. Однако упомянутые слова, услышанные от Яна из Глогова, могли вызвать в критическом уме Коперника мысль, не правильнее ли будет перенести центр мироздания на Солнце, а Земле придать движение и именно таким образом искать решения трудных проблем, которые не удалось решить ни в теории гомоцентрических сфер, ни в теории эксцентриков и эпициклов. Импульс к тому, чтобы поместить Солнце в центре мироздания, мог исходить и с другой стороны, а именно от кружка лиц, интересующихся философией Платона. Здесь некоторую роль могло сыграть общество «Sodalitas Vistulana», где проявлялся большой интерес к этой философии. Сторонники философии Платона придавали Солнцу особую роль в мире. Ведущий пропагандист философии Платона Марсилио Фичино из Флоренции издал в 1489 году трактат De sole et Lumine (0 солнце и свете), в котором писал о Солнце как величайшем светиле, расположенном в центре неба и управляющем гармоничным движением мира. Сразу же после опубликования трактата Фичино прислал несколько экземпляров в Краков своему другу Каллимаху, а от этого последнего книга могла уже попасть к членам общества «Sodalitas Vistulana». Впрочем, Каллимах был дружен с епископом Лукашем Ваценроде. Коперник же был вхож к нему и мог ознакомиться с книгой Фичино уже на пороге своей университетской жизни.
Фичино не делал никаких выводов о строении мироздания из своего воззрения на положение Солнца, не делали их и другие приверженцы философии Платона. В мыслях же Николая Коперника как под влиянием университетских лекций, так и воззрений платонистов на положение Солнца могло укрепиться убеждение в необходимости признать Солнце центром мироздания, а в конечном итоге необходимости признать Землю одной из планет, вращающихся вокруг Солнца.
Однако от первых предположений до создания научной теории путь весьма далек. Коперник в своей научной работе отбрасывал спекулятивные методы исследований и, подобно современным ученым, внимательно изучал все, что могли сказать о волновавшей его проблеме другие. Как гуманист и человек эпохи Возрождения, он решил прежде всего обратиться к античным авторам. Это потребовало долгих лет труда, необходимо было изучить многие работы, подчас труднодоступные, вдобавок написанные не только по-латыни, но и на греческом языке, которого Коперник тогда еще не знал. И только после ознакомления с теорией Птолемея, к которому Коперник всегда относился с большим уважением, хотя и выступал с критикой его теории, а затем после изучения всей доступной ему литературы, где упоминалось о движении планет, он смог облечь свои идеи в форму математической теории такого же масштаба, как великий Альмагест.
Едва ли можно с уверенностью говорить, что уже во время учебы в Кракове в сознании Коперника окончательно оформился гелиоцентрический взгляд на теорию строения мира. Однако можно утверждать, что уже тогда Коперник пришел к убеждению о неправильности основных положений геоцентрической теории строения мира.
Некоторым подтверждением нашего предположения о том, что концепция гелиоцентрического строения мира родилась в уме молодого Коперника во время его учебы в Кракове, могут быть слова Войцеха Капринуса в письме из Кракова, направленном 27 ноября 1542 года епископу Самуэлю Мацеёвскому. В этом письме Капринус пишет: «Николай Коперник, каноник вармийский (...), начала своих достойных восхищения математических трудов, которые он уже сочинил и которые в еще большем количестве намерен опубликовать, почерпнул из нашего университета, чего он не только не отрицает (...), а напротив, признает, что всем, чем он есть, он обязан нашей Академии».
Слова эти были написаны еще при жизни Коперника и, видимо, опирались на какое-то его высказывание. Известно, что идея об истинном строении мироздания не покидала Коперника до конца его жизни. И если Коперник заявил, что всем, чем он есть, он обязан краковской Академии, то можно сделать вывод, что этой Академии, влиянию краковских ученых он обязан возникшей в его уме догадкой, положившей начало новой теории строения мироздания.
Новая идея о строении мироздания была столь смелой, что Коперник опасался с кем-либо поделиться ею. И дело здесь, конечно, не в боязни потерять приоритет, а в том, что - как он написал позднее в посвящении книги О вращениях небесных сфер папе римскому - слишком многим она могла паказаться нелепой и смешной. Прежде чем предавать теорию гласности, необходимо было ее научно разработать, и поэтому Коперник с большой радостью воспринял решение Вармийского капитула послать его для обучения в Италию, по тем временам настоящий кладезь античных знаний.
Коперник был искренне привязан к Кракову - столице родной страны, к городу, где он учился и где родилась его идея. Эта привязанность получила выражение в позднейшей переписке с краковскими друзьями, например, с Бернардом Ваповским, младшим его товарищем по университету, поступившим туда в 1493 году, с Марцином Бемом из Олькуша и другими. И позднее, проводя астрономические наблюдения, в далеком Фромборке, Коперник относил их к краковскому меридиану.
Все это позволяет предположить, что уже в 1496 году, выезжая в Италию, Коперник был твердо убежден в необходимости изменения старой концепции строения мира и замены геоцентрической теории - гелиоцентрической.